为进一步加强团的组织建设，健全团的基层组织机构，深入贯彻党管青年原则，充分发挥党联系青年的桥梁和纽带作用，加强青年学生思想政治工作，强化共青团带领青年大学生在学校学习实践中发挥生力军和突击队作用。按照《中国共产主义青年团章程》《中国共产主义青年团职业院校基层组织工作条例（试行）》以及学校《共青团改革实施方案》等文件规定，共青团陕西机电职业技术学院委员会共设7个二级学院团总支：

共青团智能制造学院总支部委员会

共青团电子信息学院总支部委员会

共青团交通运输学院总支部委员会

共青团铁道工程学院总支部委员会

共青团数字经管学院总支部委员会

共青团机械工程学院总支部委员会

共青团铁路司机学院总支部委员会

    各二级学院团总支设委员 5-7 人，其中团总支书记 1 人，副书记 2 人，团总支书记由二级学院学工办主任或辅导员担任，副书记由所在单位符合团章规定的辅导员和学生兼职担任。各二级学院团总支下设组织宣传部、创业实践部、青年服务部、社团工作部等 4 个工作部门，并设部长各 1 人，其中组织宣传部部长须由团总支委员担任。